Задание 1

Вид Медоносная пчела/Apis mellifera
Число сборок генома 4
Сборка Amel_HAv3.1
Общая длина 225,250,884
Контиги 228
Скэффолды 177
Scaffold/Contig N50 13,619,445/5,382,476
Scaffold/Contig L50 7/13
Аннотированные белки 31508
Публикация -
Контиг Ссылка RefSeq

Задание 2

Feature key Описание Примеры
assembly_gap Промежуток между двумя компонентами сборки генома "3271..3464
/standard_name=""RH136367""
/db_xref=""UniSTS:210357"""
CDS Кодирующая последовательность "join(<14002..14280,14849..14914,15573..15685)
/note=""putative""
/codon_start=3
/product=""TCR delta chain constant region""
/protein_id=""BAB83180.1""
/translation=""SQPNSKPSVFVMKNGTNVACLVKDFYPKDIKISLESSKKITEYD
PAIVVSPTGKYSAVKLGQYGDPDAVTCSVQHDQKTLHSADFEPKKNSSETPKPKESEN
VKQTSEICYEPQVQAWKVNMMSVTVLGFRMLFAKSVAVNFLLTAKLFFF""
intron Участок ДНК, удаляемый из мРНК после транскрипции " 14281..14848
/note=""TCR delta chain constant region;
/number=1"
old_sequence Данная последовательность повторяет старую в этом участке
protein_bind Участок нековалентного прикрепления белка
regulatory Участок, участвующий в регуляции транскрипции, трансляции и репликации "19545..19550
/regulatory_class=""polyA_signal_sequence""
/note=""putative"""
repeat_region Участок генома, содержащий повторы
complement(39025..39124)
/note="repeat region RepG_Hs"

Задание 3

1000 Fungal genomes project. Проект был запущен в 2012 году на базе американского Joint genome institute и все еще продолжается, его цель секвенировать более 1000 геномов грибов. На апрель 2017 секвенировано более 800 геномов.

Задание 4

Текст запроса в ENA: mol_type="genomic DNA" AND topology="CIRCULAR" AND organelle="mitochondrion" AND tax_tree(73615)

Release:1 Update:1

Вид: Huperzia squarrosa/Баранец растопыренный

AC: JQ002659.1

Файл с таблицей и скрипт